Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTHFD1P11586 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFD1P11586 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms