Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PKHD1P08F94 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PKHD1P08F94 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PKHD1P08F94 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PKHD1P08F94 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PKHD1P08F94 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PKHD1P08F94 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PKHD1P08F94 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PKHD1P08F94 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PKHD1P08F94 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PKHD1P08F94 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PKHD1P08F94 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PKHD1P08F94 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PKHD1P08F94 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PKHD1P08F94 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PKHD1P08F94 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PKHD1P08F94 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PKHD1P08F94 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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PKHD1P08F94 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PKHD1P08F94 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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PKHD1P08F94 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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PKHD1P08F94 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PKHD1P08F94 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PKHD1P08F94 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PKHD1P08F94 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PKHD1P08F94 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PKHD1P08F94 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PKHD1P08F94 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PKHD1P08F94 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PKHD1P08F94 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PKHD1P08F94 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PKHD1P08F94 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PKHD1P08F94 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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PKHD1P08F94 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKHD1P08F94 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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