Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms