Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC46.84■■■■■ 5.09
ABCC9O60706 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC46.84■■■■■ 5.09
ABCC9O60706 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC46.84■■■■■ 5.09
ABCC9O60706 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.84■■■■■ 5.09
ABCC9O60706 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
ABCC9O60706 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.83■■■■■ 5.09
ABCC9O60706 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.83■■■■■ 5.09
ABCC9O60706 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC46.83■■■■■ 5.09
ABCC9O60706 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.83■■■■■ 5.09
ABCC9O60706 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
ABCC9O60706 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC46.82■■■■■ 5.09
ABCC9O60706 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC46.82■■■■■ 5.09
ABCC9O60706 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.81■■■■■ 5.08
ABCC9O60706 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC46.81■■■■■ 5.08
ABCC9O60706 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
ABCC9O60706 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC46.81■■■■■ 5.08
ABCC9O60706 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC46.8■■■■■ 5.08
ABCC9O60706 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC46.8■■■■■ 5.08
ABCC9O60706 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC46.8■■■■■ 5.08
ABCC9O60706 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC46.8■■■■■ 5.08
ABCC9O60706 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
ABCC9O60706 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
ABCC9O60706 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
ABCC9O60706 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC46.79■■■■■ 5.08
ABCC9O60706 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC46.79■■■■■ 5.08
ABCC9O60706 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
ABCC9O60706 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
ABCC9O60706 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC46.78■■■■■ 5.08
ABCC9O60706 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
ABCC9O60706 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC46.77■■■■■ 5.08
ABCC9O60706 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC46.77■■■■■ 5.08
ABCC9O60706 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.77■■■■■ 5.08
ABCC9O60706 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
ABCC9O60706 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC46.76■■■■■ 5.08
ABCC9O60706 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC46.75■■■■■ 5.08
ABCC9O60706 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.75■■■■■ 5.07
ABCC9O60706 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
ABCC9O60706 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC46.75■■■■■ 5.07
ABCC9O60706 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC46.75■■■■■ 5.07
ABCC9O60706 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
ABCC9O60706 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC46.74■■■■■ 5.07
ABCC9O60706 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
ABCC9O60706 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
ABCC9O60706 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC46.74■■■■■ 5.07
ABCC9O60706 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
ABCC9O60706 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
ABCC9O60706 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC46.73■■■■■ 5.07
ABCC9O60706 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC46.73■■■■■ 5.07
ABCC9O60706 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC46.73■■■■■ 5.07
ABCC9O60706 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
ABCC9O60706 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
ABCC9O60706 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
ABCC9O60706 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
ABCC9O60706 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC46.71■■■■■ 5.07
ABCC9O60706 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC46.71■■■■■ 5.07
ABCC9O60706 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
ABCC9O60706 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
ABCC9O60706 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC46.7■■■■■ 5.07
ABCC9O60706 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC46.7■■■■■ 5.07
ABCC9O60706 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC46.7■■■■■ 5.07
ABCC9O60706 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC46.7■■■■■ 5.07
ABCC9O60706 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
ABCC9O60706 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC46.69■■■■■ 5.07
ABCC9O60706 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC46.69■■■■■ 5.06
ABCC9O60706 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC46.69■■■■■ 5.06
ABCC9O60706 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC46.69■■■■■ 5.06
ABCC9O60706 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.06
ABCC9O60706 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC46.68■■■■■ 5.06
ABCC9O60706 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
ABCC9O60706 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
ABCC9O60706 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC46.67■■■■■ 5.06
ABCC9O60706 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC46.66■■■■■ 5.06
ABCC9O60706 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
ABCC9O60706 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
ABCC9O60706 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
ABCC9O60706 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
ABCC9O60706 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
ABCC9O60706 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC46.65■■■■■ 5.06
ABCC9O60706 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC46.64■■■■■ 5.06
ABCC9O60706 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
ABCC9O60706 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC46.64■■■■■ 5.06
ABCC9O60706 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC46.64■■■■■ 5.06
ABCC9O60706 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC46.64■■■■■ 5.06
ABCC9O60706 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.63■■■■■ 5.06
ABCC9O60706 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC46.63■■■■■ 5.05
ABCC9O60706 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC46.63■■■■■ 5.05
ABCC9O60706 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
ABCC9O60706 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
ABCC9O60706 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC46.62■■■■■ 5.05
ABCC9O60706 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC46.62■■■■■ 5.05
ABCC9O60706 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
ABCC9O60706 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.61■■■■■ 5.05
ABCC9O60706 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC46.61■■■■■ 5.05
ABCC9O60706 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
ABCC9O60706 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.61■■■■■ 5.05
ABCC9O60706 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC46.6■■■■■ 5.05
ABCC9O60706 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC46.6■■■■■ 5.05
ABCC9O60706 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.6■■■■■ 5.05
ABCC9O60706 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC46.6■■■■■ 5.05
ABCC9O60706 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC46.6■■■■■ 5.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms