Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCO2O43819 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCO2O43819 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCO2O43819 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCO2O43819 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCO2O43819 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCO2O43819 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCO2O43819 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCO2O43819 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCO2O43819 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCO2O43819 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCO2O43819 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCO2O43819 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCO2O43819 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCO2O43819 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCO2O43819 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SCO2O43819 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SCO2O43819 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCO2O43819 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCO2O43819 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCO2O43819 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCO2O43819 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCO2O43819 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SCO2O43819 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SCO2O43819 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCO2O43819 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCO2O43819 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCO2O43819 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCO2O43819 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCO2O43819 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCO2O43819 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCO2O43819 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SCO2O43819 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCO2O43819 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCO2O43819 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCO2O43819 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCO2O43819 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCO2O43819 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCO2O43819 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCO2O43819 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCO2O43819 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCO2O43819 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCO2O43819 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCO2O43819 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCO2O43819 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCO2O43819 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCO2O43819 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCO2O43819 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCO2O43819 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCO2O43819 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCO2O43819 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCO2O43819 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCO2O43819 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCO2O43819 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCO2O43819 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SCO2O43819 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SCO2O43819 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCO2O43819 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCO2O43819 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCO2O43819 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCO2O43819 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCO2O43819 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCO2O43819 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCO2O43819 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCO2O43819 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCO2O43819 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCO2O43819 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCO2O43819 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCO2O43819 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCO2O43819 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SCO2O43819 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCO2O43819 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCO2O43819 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCO2O43819 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCO2O43819 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCO2O43819 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCO2O43819 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCO2O43819 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCO2O43819 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCO2O43819 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCO2O43819 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCO2O43819 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCO2O43819 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCO2O43819 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCO2O43819 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCO2O43819 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCO2O43819 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCO2O43819 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCO2O43819 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCO2O43819 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SCO2O43819 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCO2O43819 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCO2O43819 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SCO2O43819 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SCO2O43819 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCO2O43819 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCO2O43819 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCO2O43819 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCO2O43819 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCO2O43819 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms