Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LRRTM2O43300 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRRTM2O43300 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRTM2O43300 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRTM2O43300 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRTM2O43300 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LRRTM2O43300 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LRRTM2O43300 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRTM2O43300 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRTM2O43300 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRTM2O43300 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRTM2O43300 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRTM2O43300 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRTM2O43300 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRTM2O43300 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRTM2O43300 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRTM2O43300 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRTM2O43300 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRTM2O43300 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRTM2O43300 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRTM2O43300 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRTM2O43300 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LRRTM2O43300 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LRRTM2O43300 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LRRTM2O43300 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LRRTM2O43300 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LRRTM2O43300 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRTM2O43300 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRTM2O43300 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LRRTM2O43300 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRTM2O43300 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRTM2O43300 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRTM2O43300 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRTM2O43300 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRTM2O43300 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRTM2O43300 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRTM2O43300 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRTM2O43300 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRTM2O43300 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LRRTM2O43300 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRTM2O43300 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRTM2O43300 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRTM2O43300 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRTM2O43300 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRTM2O43300 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRTM2O43300 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRTM2O43300 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRTM2O43300 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRTM2O43300 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRTM2O43300 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRTM2O43300 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRTM2O43300 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRTM2O43300 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRTM2O43300 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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