Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PALM3A6NDB9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PALM3A6NDB9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PALM3A6NDB9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PALM3A6NDB9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PALM3A6NDB9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PALM3A6NDB9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PALM3A6NDB9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PALM3A6NDB9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PALM3A6NDB9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PALM3A6NDB9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PALM3A6NDB9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PALM3A6NDB9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PALM3A6NDB9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PALM3A6NDB9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PALM3A6NDB9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PALM3A6NDB9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms