Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y597

KCTD3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3Q9Y597 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCTD3Q9Y597 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms