Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms