Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL6

PCTP, Phosphatidylcholine transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCTPQ9UKL6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCTPQ9UKL6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms