Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DKK2Q9UBU2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms