Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC17A6Q9P2U8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms