Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.8 ms