Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
UPF3BQ9BZI7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms