Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC106Q9BWC9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC106Q9BWC9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC106Q9BWC9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms