Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW27

NUP85, Nuclear pore complex protein Nup85, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP85Q9BW27 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP85Q9BW27 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP85Q9BW27 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP85Q9BW27 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms