Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDCA3Q99618 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms