Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXH5

SOCS4, Suppressor of cytokine signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS4Q8WXH5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOCS4Q8WXH5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOCS4Q8WXH5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOCS4Q8WXH5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOCS4Q8WXH5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SOCS4Q8WXH5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOCS4Q8WXH5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SOCS4Q8WXH5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SOCS4Q8WXH5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SOCS4Q8WXH5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SOCS4Q8WXH5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOCS4Q8WXH5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOCS4Q8WXH5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SOCS4Q8WXH5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOCS4Q8WXH5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOCS4Q8WXH5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOCS4Q8WXH5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOCS4Q8WXH5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOCS4Q8WXH5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.8 ms