Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATRIPQ8WXE1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATRIPQ8WXE1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATRIPQ8WXE1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms