Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf3Q8WVX3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4orf3Q8WVX3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms