Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSG1

RNF165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF165Q6ZSG1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF165Q6ZSG1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF165Q6ZSG1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF165Q6ZSG1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF165Q6ZSG1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF165Q6ZSG1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF165Q6ZSG1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF165Q6ZSG1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF165Q6ZSG1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF165Q6ZSG1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF165Q6ZSG1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF165Q6ZSG1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF165Q6ZSG1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF165Q6ZSG1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF165Q6ZSG1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF165Q6ZSG1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF165Q6ZSG1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF165Q6ZSG1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF165Q6ZSG1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF165Q6ZSG1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF165Q6ZSG1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF165Q6ZSG1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF165Q6ZSG1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF165Q6ZSG1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF165Q6ZSG1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF165Q6ZSG1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF165Q6ZSG1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF165Q6ZSG1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF165Q6ZSG1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF165Q6ZSG1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF165Q6ZSG1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF165Q6ZSG1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF165Q6ZSG1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF165Q6ZSG1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF165Q6ZSG1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF165Q6ZSG1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF165Q6ZSG1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF165Q6ZSG1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF165Q6ZSG1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF165Q6ZSG1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF165Q6ZSG1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF165Q6ZSG1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF165Q6ZSG1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF165Q6ZSG1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF165Q6ZSG1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF165Q6ZSG1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF165Q6ZSG1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF165Q6ZSG1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF165Q6ZSG1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF165Q6ZSG1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF165Q6ZSG1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF165Q6ZSG1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF165Q6ZSG1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms