Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF04

ZNF613, Zinc finger protein 613, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF613Q6PF04 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF613Q6PF04 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF613Q6PF04 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.3 ms