Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LETMD1Q6P1Q0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms