Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD1

TIMM23B, Putative mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim23B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM23BQ5SRD1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMM23BQ5SRD1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms