Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NTRK2Q16620 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NTRK2Q16620 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK2Q16620 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK2Q16620 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NTRK2Q16620 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK2Q16620 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK2Q16620 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK2Q16620 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK2Q16620 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK2Q16620 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK2Q16620 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK2Q16620 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK2Q16620 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK2Q16620 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK2Q16620 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NTRK2Q16620 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NTRK2Q16620 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NTRK2Q16620 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NTRK2Q16620 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NTRK2Q16620 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NTRK2Q16620 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NTRK2Q16620 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NTRK2Q16620 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NTRK2Q16620 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NTRK2Q16620 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NTRK2Q16620 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NTRK2Q16620 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
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