Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNX2Q13950 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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