Protein–RNA interactions for Protein: Q12516

SRF1, Regulator of phospholipase D SRF1, yeastyeast

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRF1Q12516 HED1YDR014W-A 489 nt7.29□□□□□ -1.24
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SRF1Q12516 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.29□□□□□ -1.24
SRF1Q12516 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.29□□□□□ -1.24
SRF1Q12516 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.29□□□□□ -1.24
SRF1Q12516 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.29□□□□□ -1.24
SRF1Q12516 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.29□□□□□ -1.24
SRF1Q12516 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.29□□□□□ -1.24
SRF1Q12516 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.29□□□□□ -1.24
SRF1Q12516 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.29□□□□□ -1.24
SRF1Q12516 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.29□□□□□ -1.24
SRF1Q12516 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.29□□□□□ -1.24
SRF1Q12516 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.29□□□□□ -1.24
SRF1Q12516 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.29□□□□□ -1.24
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SRF1Q12516 RPT3YDR394W 1287 nt7.29□□□□□ -1.24
SRF1Q12516 MRP49YKL167C 414 nt7.29□□□□□ -1.24
SRF1Q12516 RRT7YLL030C 342 nt7.29□□□□□ -1.24
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SRF1Q12516 REC102YLR329W 795 nt7.29□□□□□ -1.24
SRF1Q12516 SUB1YMR039C 879 nt7.29□□□□□ -1.24
SRF1Q12516 RCF2YNR018W 675 nt7.29□□□□□ -1.24
SRF1Q12516 SER1YOR184W 1188 nt7.29□□□□□ -1.24
SRF1Q12516 SEC62YPL094C 825 nt7.29□□□□□ -1.24
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SRF1Q12516 VBA5YKR105C 1749 nt7.29□□□□□ -1.24
SRF1Q12516 SKS1YPL026C 1509 nt7.28□□□□□ -1.24
SRF1Q12516 YDL218WYDL218W 954 nt7.28□□□□□ -1.24
SRF1Q12516 OCA6YDR067C 675 nt7.28□□□□□ -1.24
SRF1Q12516 SPR28YDR218C 1272 nt7.28□□□□□ -1.24
SRF1Q12516 GLC7YER133W 939 nt7.28□□□□□ -1.24
SRF1Q12516 CKB1YGL019W 837 nt7.28□□□□□ -1.24
SRF1Q12516 SFK1YKL051W 1062 nt7.28□□□□□ -1.24
SRF1Q12516 YML119WYML119W 1074 nt7.28□□□□□ -1.24
SRF1Q12516 YNL050CYNL050C 813 nt7.28□□□□□ -1.24
SRF1Q12516 RTC2YBR147W 891 nt7.28□□□□□ -1.24
SRF1Q12516 HBS1YKR084C 1836 nt7.28□□□□□ -1.24
SRF1Q12516 COR1YBL045C 1374 nt7.28□□□□□ -1.24
SRF1Q12516 MCH1YDL054C 1461 nt7.28□□□□□ -1.24
SRF1Q12516 YNL011CYNL011C 1335 nt7.27□□□□□ -1.24
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SRF1Q12516 CTR2YHR175W 570 nt7.27□□□□□ -1.25
SRF1Q12516 PFS1YHR185C 714 nt7.27□□□□□ -1.25
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SRF1Q12516 HRT3YLR097C 1035 nt7.27□□□□□ -1.25
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SRF1Q12516 MDY2YOL111C 639 nt7.27□□□□□ -1.25
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SRF1Q12516 LEO1YOR123C 1395 nt7.27□□□□□ -1.25
SRF1Q12516 RUD3YOR216C 1455 nt7.27□□□□□ -1.25
SRF1Q12516 PAP2YOL115W 1755 nt7.27□□□□□ -1.25
SRF1Q12516 JIP4YDR475C 2631 nt7.27□□□□□ -1.25
SRF1Q12516 FDC1YDR539W 1512 nt7.27□□□□□ -1.25
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SRF1Q12516 YLR446WYLR446W 1302 nt7.27□□□□□ -1.25
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SRF1Q12516 SDH3YKL141W 597 nt7.26□□□□□ -1.25
SRF1Q12516 CKS1YBR135W 453 nt7.26□□□□□ -1.25
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SRF1Q12516 ARO4YBR249C 1113 nt7.26□□□□□ -1.25
SRF1Q12516 YBR255C-AYBR255C-A 363 nt7.26□□□□□ -1.25
SRF1Q12516 CDC7YDL017W 1524 nt7.26□□□□□ -1.25
SRF1Q12516 YLL066CYLL066C 3618 nt7.26□□□□□ -1.25
SRF1Q12516 YLL067CYLL067C 3618 nt7.26□□□□□ -1.25
SRF1Q12516 DXO1YDR370C 1329 nt7.26□□□□□ -1.25
SRF1Q12516 IME2YJL106W 1938 nt7.25□□□□□ -1.25
SRF1Q12516 ICL2YPR006C 1728 nt7.25□□□□□ -1.25
SRF1Q12516 DET1YDR051C 1005 nt7.25□□□□□ -1.25
SRF1Q12516 PAD1YDR538W 729 nt7.25□□□□□ -1.25
SRF1Q12516 ACT1YFL039C 1128 nt7.25□□□□□ -1.25
SRF1Q12516 COS8YHL048W 1146 nt7.25□□□□□ -1.25
SRF1Q12516 AAT2YLR027C 1257 nt7.25□□□□□ -1.25
SRF1Q12516 MIM1YOL026C 342 nt7.25□□□□□ -1.25
SRF1Q12516 TMA46YOR091W 1038 nt7.25□□□□□ -1.25
SRF1Q12516 YOR338WYOR338W 1092 nt7.25□□□□□ -1.25
SRF1Q12516 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt7.25□□□□□ -1.25
SRF1Q12516 RVB2YPL235W 1416 nt7.25□□□□□ -1.25
SRF1Q12516 HOS1YPR068C 1413 nt7.25□□□□□ -1.25
SRF1Q12516 AIM6YDL237W 1173 nt7.24□□□□□ -1.25
SRF1Q12516 PEP8YJL053W 1140 nt7.24□□□□□ -1.25
SRF1Q12516 YOR041CYOR041C 432 nt7.24□□□□□ -1.25
SRF1Q12516 YPL199CYPL199C 723 nt7.24□□□□□ -1.25
SRF1Q12516 KAR4YCL055W 1008 nt7.24□□□□□ -1.25
SRF1Q12516 WTM2YOR229W 1404 nt7.24□□□□□ -1.25
SRF1Q12516 PGI1YBR196C 1665 nt7.23□□□□□ -1.25
SRF1Q12516 CPR4YCR069W 957 nt7.23□□□□□ -1.25
SRF1Q12516 BUG1YDL099W 1026 nt7.23□□□□□ -1.25
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