Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	IMD1	YAR073W	1212 nt		5.01	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	CSR1	YLR380W	1227 nt		5.01	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	PGM2	YMR105C	1710 nt		5	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	NOP7	YGR103W	1818 nt		5	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	YPT32	YGL210W	669 nt		5	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	PRP45	YAL032C	1140 nt		5	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	YLR184W	YLR184W	348 nt		5	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	ROX3	YBL093C	663 nt		5	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	QCR2	YPR191W	1107 nt		5	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	MBP1	YDL056W	2502 nt		5	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	GIP2	YER054C	1647 nt		5	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	YNL247W	YNL247W	2304 nt		5	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	FAA3	YIL009W	2085 nt		5	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	LYS21	YDL131W	1323 nt		4.99	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	ECM7	YLR443W	1347 nt		4.99	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	PEX29	YDR479C	1665 nt		4.99	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	YDL034W	YDL034W	345 nt		4.99	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	SCW4	YGR279C	1161 nt		4.99	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	HSX1	tR(CCU)J	72 nt		4.99	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	REV7	YIL139C	738 nt		4.99	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	YMR030W-A	YMR030W-A	291 nt		4.99	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	YEF1	YEL041W	1488 nt		4.99	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	MEC3	YLR288C	1425 nt		4.98	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	SNO4	YMR322C	714 nt		4.98	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	HSP33	YOR391C	714 nt		4.98	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	HSP32	YPL280W	714 nt		4.98	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	YBR126W-A	YBR126W-A	207 nt		4.98	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	ATG20	YDL113C	1923 nt		4.97	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	PRP43	YGL120C	2304 nt		4.97	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	ERD1	YDR414C	1089 nt		4.97	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	RMR1	YGL250W	726 nt		4.97	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	YJL211C	YJL211C	444 nt		4.97	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	TFS1	YLR178C	660 nt		4.97	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	SWP1	YMR149W	861 nt		4.97	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	COG5	YNL051W	1212 nt		4.97	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	CDC21	YOR074C	915 nt		4.97	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	MSH1	YHR120W	2880 nt		4.97	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	EMP46	YLR080W	1335 nt		4.97	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	KRE6	YPR159W	2163 nt		4.97	□□□□□ -1.61
VIK1	Q12045	YDR261C-D	YDR261C-D	4815 nt		4.96	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	SAP155	YFR040W	3009 nt		4.96	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	YTA12	YMR089C	2478 nt		4.96	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	IPK1	YDR315C	846 nt		4.96	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	YJU2	YKL095W	837 nt		4.96	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	DNF2	YDR093W	4839 nt		4.96	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	KRS1	YDR037W	1776 nt		4.96	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	MNT2	YGL257C	1677 nt		4.96	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	STP4	YDL048C	1473 nt		4.95	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	TOS4	YLR183C	1470 nt		4.95	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	IES1	YFL013C	2079 nt		4.95	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	YCR097W-A	YCR097W-A	267 nt		4.95	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	CAD1	YDR423C	1230 nt		4.95	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	UTR4	YEL038W	684 nt		4.95	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	LST8	YNL006W	912 nt		4.95	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	NPT1	YOR209C	1290 nt		4.95	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	YCL021W-A	YCL021W-A	378 nt		4.95	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	BRE2	YLR015W	1518 nt		4.95	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	UBX7	YBR273C	1311 nt		4.95	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	ROT2	YBR229C	2865 nt		4.94	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	MCM4	YPR019W	2802 nt		4.94	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	TFB3	YDR460W	966 nt		4.94	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	CAB4	YGR277C	918 nt		4.94	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	ARR3	YPR201W	1215 nt		4.94	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	YCL012C	YCL012C	405 nt		4.94	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	NOT3	YIL038C	2511 nt		4.94	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	ATG23	YLR431C	1362 nt		4.93	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	SFI1	YLL003W	2841 nt		4.93	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	APE1	YKL103C	1545 nt		4.93	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	MIM2	YLR099W-A	264 nt		4.93	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	RPL21B	YPL079W	483 nt		4.93	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	CPS1	YJL172W	1731 nt		4.92	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	FZO1	YBR179C	2568 nt		4.92	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	GIP1	YBR045C	1920 nt		4.92	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	LHP1	YDL051W	828 nt		4.92	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	RPL34A	YER056C-A	366 nt		4.92	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	YHR145C	YHR145C	357 nt		4.92	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	COS9	YKL219W	1224 nt		4.92	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	MRPL36	YBR122C	534 nt		4.92	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	SLC1	YDL052C	912 nt		4.91	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	YEL009C-A	YEL009C-A	408 nt		4.91	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	YEL045C	YEL045C	426 nt		4.91	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	GAL83	YER027C	1254 nt		4.91	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	AVO2	YMR068W	1281 nt		4.91	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	YOL097W-A	YOL097W-A	186 nt		4.91	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	DCC1	YCL016C	1143 nt		4.91	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	CDC19	YAL038W	1503 nt		4.91	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	NDC1	YML031W	1968 nt		4.91	□□□□□ -1.62
VIK1	Q12045	ETT1	YOR051C	1239 nt		4.9	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	CBC2	YPL178W	627 nt		4.9	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	FRE1	YLR214W	2061 nt		4.9	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	SRG1	SRG1	551 nt		4.89	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	SPL2	YHR136C	447 nt		4.89	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	YIR017W-A	YIR017W-A	600 nt		4.89	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	DOA1	YKL213C	2148 nt		4.89	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	MET31	YPL038W	534 nt		4.89	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	YBR230W-A	YBR230W-A	201 nt		4.89	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	PRR1	YKL116C	1557 nt		4.89	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	ZUO1	YGR285C	1302 nt		4.89	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	TUB3	YML124C	1338 nt		4.89	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	YLH47	YPR125W	1365 nt		4.89	□□□□□ -1.63

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