Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSNK2A1P68400 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSNK2A1P68400 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSNK2A1P68400 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSNK2A1P68400 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSNK2A1P68400 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSNK2A1P68400 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSNK2A1P68400 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSNK2A1P68400 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSNK2A1P68400 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSNK2A1P68400 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSNK2A1P68400 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSNK2A1P68400 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSNK2A1P68400 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CSNK2A1P68400 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSNK2A1P68400 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSNK2A1P68400 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSNK2A1P68400 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSNK2A1P68400 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSNK2A1P68400 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CSNK2A1P68400 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms