Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NCS1P62166 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NCS1P62166 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NCS1P62166 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
NCS1P62166 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCS1P62166 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCS1P62166 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCS1P62166 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCS1P62166 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCS1P62166 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NCS1P62166 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCS1P62166 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCS1P62166 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCS1P62166 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCS1P62166 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCS1P62166 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCS1P62166 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCS1P62166 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NCS1P62166 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCS1P62166 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCS1P62166 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCS1P62166 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCS1P62166 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCS1P62166 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCS1P62166 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCS1P62166 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCS1P62166 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NCS1P62166 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCS1P62166 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NCS1P62166 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCS1P62166 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCS1P62166 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCS1P62166 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCS1P62166 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCS1P62166 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCS1P62166 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCS1P62166 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NCS1P62166 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCS1P62166 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCS1P62166 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NCS1P62166 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NCS1P62166 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCS1P62166 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCS1P62166 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCS1P62166 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCS1P62166 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCS1P62166 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCS1P62166 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCS1P62166 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCS1P62166 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCS1P62166 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCS1P62166 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCS1P62166 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCS1P62166 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCS1P62166 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCS1P62166 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCS1P62166 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCS1P62166 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCS1P62166 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCS1P62166 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCS1P62166 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCS1P62166 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCS1P62166 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCS1P62166 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCS1P62166 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCS1P62166 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCS1P62166 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NCS1P62166 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NCS1P62166 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NCS1P62166 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NCS1P62166 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NCS1P62166 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCS1P62166 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCS1P62166 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCS1P62166 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCS1P62166 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCS1P62166 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCS1P62166 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCS1P62166 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCS1P62166 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NCS1P62166 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCS1P62166 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCS1P62166 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCS1P62166 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCS1P62166 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCS1P62166 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCS1P62166 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCS1P62166 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCS1P62166 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCS1P62166 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCS1P62166 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCS1P62166 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCS1P62166 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCS1P62166 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCS1P62166 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCS1P62166 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCS1P62166 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCS1P62166 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCS1P62166 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCS1P62166 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms