Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ERVS71-1P61550 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms