Protein–RNA interactions for Protein: P53437

RRN9, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN9, yeastyeast

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN9P53437 FUM1YPL262W 1467 nt4.87□□□□□ -1.63
RRN9P53437 YDL034WYDL034W 345 nt4.86□□□□□ -1.63
RRN9P53437 CBP4YGR174C 513 nt4.86□□□□□ -1.63
RRN9P53437 HSX1tR(CCU)J 72 nt4.86□□□□□ -1.63
RRN9P53437 SEC13YLR208W 894 nt4.86□□□□□ -1.63
RRN9P53437 MTF1YMR228W 1026 nt4.86□□□□□ -1.63
RRN9P53437 CWC25YNL245C 540 nt4.86□□□□□ -1.63
RRN9P53437 YOR024WYOR024W 324 nt4.86□□□□□ -1.63
RRN9P53437 UGA1YGR019W 1416 nt4.86□□□□□ -1.63
RRN9P53437 YOR1YGR281W 4434 nt4.86□□□□□ -1.63
RRN9P53437 PDI1YCL043C 1569 nt4.86□□□□□ -1.63
RRN9P53437 TOS3YGL179C 1683 nt4.86□□□□□ -1.63
RRN9P53437 ECT1YGR007W 972 nt4.85□□□□□ -1.63
RRN9P53437 YGR022CYGR022C 330 nt4.85□□□□□ -1.63
RRN9P53437 MRP17YKL003C 396 nt4.85□□□□□ -1.63
RRN9P53437 COS9YKL219W 1224 nt4.85□□□□□ -1.63
RRN9P53437 RRT7YLL030C 342 nt4.85□□□□□ -1.63
RRN9P53437 RPA49YNL248C 1248 nt4.85□□□□□ -1.63
RRN9P53437 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt4.85□□□□□ -1.63
RRN9P53437 HEM15YOR176W 1182 nt4.85□□□□□ -1.63
RRN9P53437 MRPL36YBR122C 534 nt4.85□□□□□ -1.63
RRN9P53437 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt4.85□□□□□ -1.63
RRN9P53437 DIT1YDR403W 1611 nt4.85□□□□□ -1.63
RRN9P53437 YHR045WYHR045W 1683 nt4.85□□□□□ -1.63
RRN9P53437 HPC2YBR215W 1878 nt4.85□□□□□ -1.63
RRN9P53437 ATG1YGL180W 2694 nt4.85□□□□□ -1.63
RRN9P53437 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt4.84□□□□□ -1.63
RRN9P53437 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt4.84□□□□□ -1.63
RRN9P53437 XPT1YJR133W 630 nt4.84□□□□□ -1.63
RRN9P53437 PML1YLR016C 615 nt4.84□□□□□ -1.63
RRN9P53437 SSP120YLR250W 705 nt4.84□□□□□ -1.63
RRN9P53437 YMR147WYMR147W 672 nt4.84□□□□□ -1.63
RRN9P53437 RPS19BYNL302C 435 nt4.84□□□□□ -1.63
RRN9P53437 GPM3YOL056W 912 nt4.84□□□□□ -1.63
RRN9P53437 DCI1YOR180C 816 nt4.84□□□□□ -1.63
RRN9P53437 PRE2YPR103W 864 nt4.84□□□□□ -1.63
RRN9P53437 KIP2YPL155C 2121 nt4.84□□□□□ -1.64
RRN9P53437 PHO90YJL198W 2646 nt4.83□□□□□ -1.64
RRN9P53437 MBP1YDL056W 2502 nt4.83□□□□□ -1.64
RRN9P53437 RAM1YDL090C 1296 nt4.83□□□□□ -1.64
RRN9P53437 YDL119CYDL119C 924 nt4.83□□□□□ -1.64
RRN9P53437 SRG1SRG1 551 nt4.83□□□□□ -1.64
RRN9P53437 TFS1YLR178C 660 nt4.83□□□□□ -1.64
RRN9P53437 CTR3YLR411W 726 nt4.83□□□□□ -1.64
RRN9P53437 SCO1YBR037C 888 nt4.83□□□□□ -1.64
RRN9P53437 PUS1YPL212C 1635 nt4.83□□□□□ -1.64
RRN9P53437 MMR1YLR190W 1476 nt4.82□□□□□ -1.64
RRN9P53437 HOS2YGL194C 1359 nt4.82□□□□□ -1.64
RRN9P53437 LPL1YOR059C 1353 nt4.82□□□□□ -1.64
RRN9P53437 APM2YHL019C 1818 nt4.82□□□□□ -1.64
RRN9P53437 IPK1YDR315C 846 nt4.82□□□□□ -1.64
RRN9P53437 CAD1YDR423C 1230 nt4.82□□□□□ -1.64
RRN9P53437 YER084WYER084W 387 nt4.82□□□□□ -1.64
RRN9P53437 YLL059CYLL059C 507 nt4.82□□□□□ -1.64
RRN9P53437 DCN1YLR128W 810 nt4.82□□□□□ -1.64
RRN9P53437 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt4.82□□□□□ -1.64
RRN9P53437 BUB3YOR026W 1026 nt4.82□□□□□ -1.64
RRN9P53437 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt4.82□□□□□ -1.64
RRN9P53437 CTS1YLR286C 1689 nt4.82□□□□□ -1.64
RRN9P53437 MSC7YHR039C 1935 nt4.82□□□□□ -1.64
RRN9P53437 SCS2YER120W 735 nt4.81□□□□□ -1.64
RRN9P53437 YIR043CYIR043C 693 nt4.81□□□□□ -1.64
RRN9P53437 GRE1YPL223C 507 nt4.81□□□□□ -1.64
RRN9P53437 MCH4YOL119C 1506 nt4.81□□□□□ -1.64
RRN9P53437 GDB1YPR184W 4611 nt4.81□□□□□ -1.64
RRN9P53437 APM1YPL259C 1428 nt4.8□□□□□ -1.64
RRN9P53437 ASK10YGR097W 3441 nt4.8□□□□□ -1.64
RRN9P53437 CUE2YKL090W 1332 nt4.8□□□□□ -1.64
RRN9P53437 CSR1YLR380W 1227 nt4.8□□□□□ -1.64
RRN9P53437 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt4.8□□□□□ -1.64
RRN9P53437 SNN1YNL086W 309 nt4.8□□□□□ -1.64
RRN9P53437 snR10snR10 245 nt4.8□□□□□ -1.64
RRN9P53437 YPL062WYPL062W 405 nt4.8□□□□□ -1.64
RRN9P53437 MGS1YNL218W 1764 nt4.8□□□□□ -1.64
RRN9P53437 PRT1YOR361C 2292 nt4.8□□□□□ -1.64
RRN9P53437 YTA12YMR089C 2478 nt4.8□□□□□ -1.64
RRN9P53437 MEC3YLR288C 1425 nt4.8□□□□□ -1.64
RRN9P53437 FRE7YOL152W 1863 nt4.79□□□□□ -1.64
RRN9P53437 ULA1YPL003W 1389 nt4.79□□□□□ -1.64
RRN9P53437 YBR138CYBR138C 1575 nt4.79□□□□□ -1.64
RRN9P53437 GPI18YBR004C 1302 nt4.79□□□□□ -1.64
RRN9P53437 UBP9YER098W 2265 nt4.79□□□□□ -1.64
RRN9P53437 WHI4YDL224C 1950 nt4.79□□□□□ -1.64
RRN9P53437 YER187WYER187W 426 nt4.79□□□□□ -1.64
RRN9P53437 GTO1YGR154C 1071 nt4.79□□□□□ -1.64
RRN9P53437 EGD2YHR193C 525 nt4.79□□□□□ -1.64
RRN9P53437 DAL82YNL314W 768 nt4.79□□□□□ -1.64
RRN9P53437 PPG1YNR032W 1107 nt4.79□□□□□ -1.64
RRN9P53437 ISU2YOR226C 471 nt4.79□□□□□ -1.64
RRN9P53437 TOS4YLR183C 1470 nt4.79□□□□□ -1.64
RRN9P53437 RTT106YNL206C 1368 nt4.78□□□□□ -1.64
RRN9P53437 PDR10YOR328W 4695 nt4.78□□□□□ -1.64
RRN9P53437 WTM1YOR230W 1314 nt4.78□□□□□ -1.64
RRN9P53437 FAA3YIL009W 2085 nt4.78□□□□□ -1.64
RRN9P53437 ADD37YMR184W 597 nt4.78□□□□□ -1.64
RRN9P53437 ROX3YBL093C 663 nt4.78□□□□□ -1.64
RRN9P53437 ALG5YPL227C 1005 nt4.78□□□□□ -1.64
RRN9P53437 YHR182WYHR182W 2358 nt4.78□□□□□ -1.64
RRN9P53437 SAP155YFR040W 3009 nt4.77□□□□□ -1.65
RRN9P53437 AAD4YDL243C 990 nt4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 96.1 ms