Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSRP3P50461 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRP3P50461 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms