Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC4A3P48751 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC4A3P48751 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC4A3P48751 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC4A3P48751 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC4A3P48751 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC4A3P48751 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC4A3P48751 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A3P48751 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A3P48751 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A3P48751 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A3P48751 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A3P48751 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A3P48751 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A3P48751 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A3P48751 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A3P48751 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A3P48751 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC4A3P48751 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC4A3P48751 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC4A3P48751 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC4A3P48751 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A3P48751 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A3P48751 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms