Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
REG1BP48304 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
REG1BP48304 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
REG1BP48304 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
REG1BP48304 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
REG1BP48304 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
REG1BP48304 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
REG1BP48304 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
REG1BP48304 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
REG1BP48304 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
REG1BP48304 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
REG1BP48304 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
REG1BP48304 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
REG1BP48304 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
REG1BP48304 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
REG1BP48304 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
REG1BP48304 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
REG1BP48304 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
REG1BP48304 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
REG1BP48304 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
REG1BP48304 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
REG1BP48304 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
REG1BP48304 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
REG1BP48304 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
REG1BP48304 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
REG1BP48304 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
REG1BP48304 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
REG1BP48304 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
REG1BP48304 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
REG1BP48304 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
REG1BP48304 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
REG1BP48304 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
REG1BP48304 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
REG1BP48304 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
REG1BP48304 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
REG1BP48304 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
REG1BP48304 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
REG1BP48304 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
REG1BP48304 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
REG1BP48304 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
REG1BP48304 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
REG1BP48304 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
REG1BP48304 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
REG1BP48304 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
REG1BP48304 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
REG1BP48304 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
REG1BP48304 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
REG1BP48304 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
REG1BP48304 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
REG1BP48304 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
REG1BP48304 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
REG1BP48304 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
REG1BP48304 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
REG1BP48304 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
REG1BP48304 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
REG1BP48304 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
REG1BP48304 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
REG1BP48304 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
REG1BP48304 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
REG1BP48304 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
REG1BP48304 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
REG1BP48304 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
REG1BP48304 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
REG1BP48304 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
REG1BP48304 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
REG1BP48304 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
REG1BP48304 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
REG1BP48304 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
REG1BP48304 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
REG1BP48304 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
REG1BP48304 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
REG1BP48304 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
REG1BP48304 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
REG1BP48304 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
REG1BP48304 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
REG1BP48304 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
REG1BP48304 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
REG1BP48304 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
REG1BP48304 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
REG1BP48304 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
REG1BP48304 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
REG1BP48304 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
REG1BP48304 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
REG1BP48304 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
REG1BP48304 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
REG1BP48304 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
REG1BP48304 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
REG1BP48304 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
REG1BP48304 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
REG1BP48304 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
REG1BP48304 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
REG1BP48304 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
REG1BP48304 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
REG1BP48304 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
REG1BP48304 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
REG1BP48304 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
REG1BP48304 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
REG1BP48304 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
REG1BP48304 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
REG1BP48304 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms