Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP2P42575 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP2P42575 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP2P42575 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP2P42575 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP2P42575 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP2P42575 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP2P42575 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP2P42575 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP2P42575 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP2P42575 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP2P42575 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP2P42575 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP2P42575 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP2P42575 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP2P42575 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP2P42575 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP2P42575 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP2P42575 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP2P42575 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP2P42575 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP2P42575 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP2P42575 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP2P42575 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP2P42575 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP2P42575 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP2P42575 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP2P42575 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP2P42575 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP2P42575 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP2P42575 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP2P42575 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP2P42575 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP2P42575 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP2P42575 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP2P42575 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP2P42575 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP2P42575 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP2P42575 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP2P42575 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP2P42575 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP2P42575 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP2P42575 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP2P42575 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP2P42575 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP2P42575 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP2P42575 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP2P42575 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP2P42575 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP2P42575 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP2P42575 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP2P42575 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP2P42575 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP2P42575 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP2P42575 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP2P42575 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP2P42575 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP2P42575 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP2P42575 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP2P42575 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP2P42575 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP2P42575 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP2P42575 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP2P42575 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP2P42575 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP2P42575 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP2P42575 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP2P42575 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP2P42575 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP2P42575 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP2P42575 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP2P42575 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP2P42575 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP2P42575 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP2P42575 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP2P42575 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP2P42575 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP2P42575 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP2P42575 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP2P42575 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP2P42575 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP2P42575 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP2P42575 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP2P42575 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP2P42575 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP2P42575 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP2P42575 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP2P42575 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP2P42575 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP2P42575 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP2P42575 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP2P42575 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP2P42575 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP2P42575 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP2P42575 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP2P42575 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP2P42575 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP2P42575 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP2P42575 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP2P42575 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.4 ms