Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CA4P22748 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CA4P22748 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CA4P22748 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CA4P22748 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CA4P22748 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CA4P22748 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CA4P22748 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CA4P22748 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CA4P22748 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CA4P22748 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CA4P22748 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CA4P22748 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CA4P22748 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CA4P22748 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CA4P22748 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CA4P22748 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CA4P22748 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CA4P22748 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CA4P22748 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CA4P22748 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CA4P22748 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CA4P22748 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CA4P22748 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CA4P22748 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CA4P22748 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CA4P22748 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CA4P22748 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CA4P22748 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CA4P22748 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CA4P22748 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CA4P22748 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CA4P22748 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CA4P22748 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CA4P22748 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CA4P22748 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CA4P22748 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CA4P22748 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CA4P22748 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CA4P22748 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CA4P22748 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CA4P22748 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CA4P22748 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CA4P22748 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CA4P22748 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CA4P22748 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CA4P22748 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CA4P22748 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CA4P22748 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CA4P22748 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CA4P22748 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CA4P22748 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CA4P22748 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CA4P22748 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CA4P22748 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CA4P22748 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CA4P22748 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CA4P22748 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CA4P22748 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CA4P22748 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CA4P22748 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CA4P22748 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CA4P22748 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CA4P22748 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CA4P22748 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CA4P22748 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CA4P22748 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CA4P22748 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CA4P22748 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CA4P22748 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CA4P22748 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CA4P22748 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CA4P22748 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CA4P22748 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CA4P22748 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CA4P22748 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CA4P22748 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CA4P22748 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CA4P22748 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CA4P22748 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CA4P22748 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CA4P22748 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CA4P22748 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CA4P22748 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CA4P22748 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CA4P22748 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CA4P22748 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CA4P22748 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CA4P22748 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CA4P22748 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CA4P22748 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CA4P22748 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CA4P22748 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CA4P22748 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CA4P22748 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CA4P22748 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CA4P22748 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CA4P22748 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CA4P22748 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CA4P22748 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms