Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C6orf47O95873 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C6orf47O95873 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms