Protein–RNA interactions for Protein: O95502

NPTXR, Neuronal pentraxin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTXRO95502 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPTXRO95502 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPTXRO95502 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NPTXRO95502 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NPTXRO95502 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NPTXRO95502 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NPTXRO95502 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NPTXRO95502 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPTXRO95502 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPTXRO95502 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPTXRO95502 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPTXRO95502 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPTXRO95502 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPTXRO95502 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPTXRO95502 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPTXRO95502 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPTXRO95502 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPTXRO95502 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms