Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNAPINO95295 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAPINO95295 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms