Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNCRIPO60506 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNCRIPO60506 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNCRIPO60506 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNCRIPO60506 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNCRIPO60506 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNCRIPO60506 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNCRIPO60506 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNCRIPO60506 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNCRIPO60506 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNCRIPO60506 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNCRIPO60506 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNCRIPO60506 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNCRIPO60506 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNCRIPO60506 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNCRIPO60506 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNCRIPO60506 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNCRIPO60506 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNCRIPO60506 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNCRIPO60506 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNCRIPO60506 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNCRIPO60506 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNCRIPO60506 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNCRIPO60506 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNCRIPO60506 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNCRIPO60506 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNCRIPO60506 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNCRIPO60506 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNCRIPO60506 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNCRIPO60506 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNCRIPO60506 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNCRIPO60506 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNCRIPO60506 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNCRIPO60506 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNCRIPO60506 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNCRIPO60506 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms