Protein–RNA interactions for Protein: O00409

FOXN3, Forkhead box protein N3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3O00409 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FOXN3O00409 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms