Protein–RNA interactions for Protein: F8VUJ3

POC1B-GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms