Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
ARFGEF2Q9Y6D5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ARFGEF2Q9Y6D5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARFGEF2Q9Y6D5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARFGEF2Q9Y6D5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARFGEF2Q9Y6D5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARFGEF2Q9Y6D5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARFGEF2Q9Y6D5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ARFGEF2Q9Y6D5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARFGEF2Q9Y6D5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARFGEF2Q9Y6D5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARFGEF2Q9Y6D5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARFGEF2Q9Y6D5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARFGEF2Q9Y6D5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARFGEF2Q9Y6D5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARFGEF2Q9Y6D5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARFGEF2Q9Y6D5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARFGEF2Q9Y6D5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARFGEF2Q9Y6D5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARFGEF2Q9Y6D5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARFGEF2Q9Y6D5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARFGEF2Q9Y6D5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARFGEF2Q9Y6D5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARFGEF2Q9Y6D5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ARFGEF2Q9Y6D5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARFGEF2Q9Y6D5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARFGEF2Q9Y6D5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARFGEF2Q9Y6D5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARFGEF2Q9Y6D5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ARFGEF2Q9Y6D5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARFGEF2Q9Y6D5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARFGEF2Q9Y6D5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ARFGEF2Q9Y6D5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ARFGEF2Q9Y6D5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ARFGEF2Q9Y6D5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARFGEF2Q9Y6D5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARFGEF2Q9Y6D5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARFGEF2Q9Y6D5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARFGEF2Q9Y6D5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARFGEF2Q9Y6D5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARFGEF2Q9Y6D5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ARFGEF2Q9Y6D5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARFGEF2Q9Y6D5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARFGEF2Q9Y6D5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARFGEF2Q9Y6D5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ARFGEF2Q9Y6D5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARFGEF2Q9Y6D5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARFGEF2Q9Y6D5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARFGEF2Q9Y6D5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARFGEF2Q9Y6D5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARFGEF2Q9Y6D5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARFGEF2Q9Y6D5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARFGEF2Q9Y6D5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARFGEF2Q9Y6D5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARFGEF2Q9Y6D5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARFGEF2Q9Y6D5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARFGEF2Q9Y6D5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms