Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y678

COPG1, Coatomer subunit gamma-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG1Q9Y678 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
COPG1Q9Y678 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPG1Q9Y678 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.8 ms