Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NOP58Q9Y2X3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
NOP58Q9Y2X3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms