Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
TNIKQ9UKE5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
TNIKQ9UKE5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
TNIKQ9UKE5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
TNIKQ9UKE5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
TNIKQ9UKE5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
TNIKQ9UKE5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
TNIKQ9UKE5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
TNIKQ9UKE5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
TNIKQ9UKE5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
TNIKQ9UKE5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
TNIKQ9UKE5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
TNIKQ9UKE5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
TNIKQ9UKE5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
TNIKQ9UKE5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
TNIKQ9UKE5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
TNIKQ9UKE5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
TNIKQ9UKE5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
TNIKQ9UKE5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
TNIKQ9UKE5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
TNIKQ9UKE5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
TNIKQ9UKE5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
TNIKQ9UKE5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
TNIKQ9UKE5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
TNIKQ9UKE5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
TNIKQ9UKE5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
TNIKQ9UKE5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
TNIKQ9UKE5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
TNIKQ9UKE5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.7
TNIKQ9UKE5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
TNIKQ9UKE5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
TNIKQ9UKE5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
TNIKQ9UKE5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TNIKQ9UKE5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
TNIKQ9UKE5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
TNIKQ9UKE5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TNIKQ9UKE5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
TNIKQ9UKE5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
TNIKQ9UKE5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
TNIKQ9UKE5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
TNIKQ9UKE5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
TNIKQ9UKE5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
TNIKQ9UKE5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
TNIKQ9UKE5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
TNIKQ9UKE5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
TNIKQ9UKE5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
TNIKQ9UKE5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
TNIKQ9UKE5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
TNIKQ9UKE5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
TNIKQ9UKE5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
TNIKQ9UKE5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
TNIKQ9UKE5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
TNIKQ9UKE5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
TNIKQ9UKE5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
TNIKQ9UKE5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
TNIKQ9UKE5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
TNIKQ9UKE5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.69
TNIKQ9UKE5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
TNIKQ9UKE5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
TNIKQ9UKE5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
TNIKQ9UKE5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
TNIKQ9UKE5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
TNIKQ9UKE5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
TNIKQ9UKE5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
TNIKQ9UKE5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
TNIKQ9UKE5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
TNIKQ9UKE5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
TNIKQ9UKE5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
TNIKQ9UKE5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
TNIKQ9UKE5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
TNIKQ9UKE5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
TNIKQ9UKE5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
TNIKQ9UKE5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
TNIKQ9UKE5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
TNIKQ9UKE5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
TNIKQ9UKE5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
TNIKQ9UKE5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
TNIKQ9UKE5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
TNIKQ9UKE5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
TNIKQ9UKE5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
TNIKQ9UKE5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
TNIKQ9UKE5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
TNIKQ9UKE5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
TNIKQ9UKE5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TNIKQ9UKE5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
TNIKQ9UKE5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TNIKQ9UKE5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
TNIKQ9UKE5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TNIKQ9UKE5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
TNIKQ9UKE5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TNIKQ9UKE5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
TNIKQ9UKE5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
TNIKQ9UKE5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
TNIKQ9UKE5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
TNIKQ9UKE5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
TNIKQ9UKE5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
TNIKQ9UKE5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
TNIKQ9UKE5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
TNIKQ9UKE5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC38■■■■□ 3.67
TNIKQ9UKE5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms