Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPAS2Q99743 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPAS2Q99743 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms