Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HHIPQ96QV1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HHIPQ96QV1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HHIPQ96QV1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms