Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG68

TTL, Tubulin--tyrosine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLQ8NG68 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTLQ8NG68 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLQ8NG68 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLQ8NG68 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLQ8NG68 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLQ8NG68 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLQ8NG68 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLQ8NG68 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLQ8NG68 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLQ8NG68 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLQ8NG68 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLQ8NG68 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLQ8NG68 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLQ8NG68 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLQ8NG68 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLQ8NG68 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLQ8NG68 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLQ8NG68 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLQ8NG68 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLQ8NG68 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLQ8NG68 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLQ8NG68 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLQ8NG68 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLQ8NG68 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLQ8NG68 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLQ8NG68 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLQ8NG68 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLQ8NG68 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLQ8NG68 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms